Lo que quieres es un sistema de "acantonamiento". Es relativamente fácil de construir y puede funcionar en analógico con los trenes circulando en digital pero, dado que todos los sistemas se basan en cortar la corriente en los carriles donde los trenes deben parar se pierden algunas ventajas del control digital de trenes y, además en este caso, es problemático conseguir que los trenes hagan paradas y arranques suaves. Algunos ejemplos de este tipo de circuitos puedes encontrar en [url]www.railwaymania.com/docs/65/rwmmag02.pdf[/url] ,
http://mimaquetaz.blogspot.com.es/2008/12/cantones.html este te da una buena explicación teórica
https://sites.google.com/site/quierounamaqueta/sistemas-de-control. También hay sistemas comerciales, de Fleischmann y Wiessman si no te animas a construirlo tu mismo.
Otra posibilidad sería que te decidieras por un control software de la maqueta, que considero es la mejor forma de plantearse una circulación realista y de conseguir un buen sistema de acantonamiento con control de la velocidad en cada tramo de forma sencilla aunque menos económica que los sistemas tradicionales.